Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATG9BQ674R7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms