Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PERM1Q5SV97 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms