Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF628Q5EBL2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms