Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYTL3Q4VX76 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms