Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KLHL38Q2WGJ6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms