Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FHOD3Q2V2M9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FHOD3Q2V2M9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms