Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HADHQ16836 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms