Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCBQ16585 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCBQ16585 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms