Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
USF2Q15853 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
USF2Q15853 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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