Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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VAMP3Q15836 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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VAMP3Q15836 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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VAMP3Q15836 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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VAMP3Q15836 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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VAMP3Q15836 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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VAMP3Q15836 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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VAMP3Q15836 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VAMP3Q15836 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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