Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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NPTX1Q15818 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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