Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRADDQ15628 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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