Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms