Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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CKAP5Q14008 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CKAP5Q14008 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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