Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RUNX3Q13761 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX3Q13761 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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