Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUL3Q13618 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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