Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LSAMPQ13449 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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