Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms