Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHAF1BQ13112 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CHAF1BQ13112 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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