Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BPTFQ12830 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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