Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PAX8Q06710 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms