Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSME1Q06323 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms