Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GBE1Q04446 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms