Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LINC00358-201ENST00000432697 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AP005202.1-202ENST00000583065 748 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 RNASE4-202ENST00000555597 1341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC005736.1-201ENST00000576810 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms