Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RHDQ02161 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHDQ02161 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms