Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CAP1Q01518 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms