Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CCL8P80075 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL8P80075 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms