Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPP1CAP62136 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PPP1CAP62136 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms