Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ABCE1P61221 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms