Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARF3P61204 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARF3P61204 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARF3P61204 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARF3P61204 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms