Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CASP9P55211 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms