Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLTCL1P53675 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLTCL1P53675 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms