Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERFP50548 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERFP50548 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERFP50548 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms