Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPIAP49247 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPIAP49247 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPIAP49247 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms