Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLD2P49005 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLD2P49005 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLD2P49005 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLD2P49005 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms