Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTGER3P43115 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms