Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC1A2P43004 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC1A2P43004 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms