Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP214P35658 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP214P35658 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP214P35658 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NUP214P35658 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms