Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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CASQ1P31415 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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CASQ1P31415 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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CASQ1P31415 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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