Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXA7P31268 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms