Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TSPOP30536 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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