Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GTF2E1P29083 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms