Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MSX1P28360 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MSX1P28360 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MSX1P28360 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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