Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXD10P28358 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms