Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMBRP28336 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBRP28336 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms