Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRZ1P23471 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms