Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RASA1P20936 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RASA1P20936 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RASA1P20936 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms