Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CREB1P16220 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms