Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CEACAM1P13688 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CEACAM1P13688 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms