Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBL4AP11441 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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UBL4AP11441 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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UBL4AP11441 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBL4AP11441 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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